?Qué nos dicen las matemáticas y la computación sobre cómo ciertas proteínas regulan la expresión genética? El caso del receptor de la vitamina D

Autor: Antonio Neme Castillo
La vitamina D es un micronutriente muy importante para los humanos. Desde hace decenios, se sabe que niveles bajos de este compuesto causan, entre otros padecimientos, raquitismo y osteomalacia. En fechas recientes, se ha asociado la carencia de vitamina D con problemas cardiacos, inmunológicos, y con ciertos tipos de cáncer. La vitamina D afecta la expresión de ciertos genes, y con ello, las respuestas del organismo ante eventos externos como infecciones, o internos, como presiones causadas por el crecimiento óseo, a través de una proteína, llamada el receptor de la vitamina D o VDR. Algunos mecanismos biológicos en los que el VDR participa se conocen gracias a experimentos -ómicos, esto es, aquellos que generan descripciones sobre la interacción de alguna proteína, en este caso, VDR, sobre ciertas regiones del genoma. En esta plática, se muestran en primera instancia, generalidades sobre regulación genética, en particular, la ejercida por la vitamina D y su receptor, y las técnicas que permiten caracterizar el impacto de la vitamina D en diversos procesos biológicos. A continuación, se describen las técnicas matemáticas y computacionales que permiten escudriñar los datos obtenidos al estudiar el impacto de la vitamina D,. Para finalizar, se describe cómo estos análisis computacionales y matemáticas permiten la elaboración de ciertos escenarios de regulación genética por parte de la vitamina D.